يستخدم حمض الميثان سلفونيك كمحفز في التفاعلات العضوية مثل تفاعلات الأسترة والألكلة والتكثيف بسبب طبيعته غير المتطايرة وقابليته للذوبان في المذيبات العضوية.
كما أنها تشارك في إنتاج إسترات النشا، وإسترات أوكسيدات الشمع، وإسترات حمض البنزويك، وإسترات الفينول، أو إسترات الألكيل.
يتفاعل مع بوروهيدريد الصوديوم في وجود المذيب القطبي رباعي هيدرو الفوران لتحضير معقد البوران-رباعي هيدرو الفوران.
يُستخدم في البطاريات نظرًا لنقاوته وخلوه من الكلوريد. وفي صناعة الأدوية، يُستخدم في تصنيع المكونات الدوائية الفعالة مثل تلميسارتان وإبروسارتان.
وهو مفيد في كروماتوغرافيا الأيونات وهو مصدر للكربون والطاقة لبعض البكتيريا الميثيلوتروبية سالبة الجرام. وهو يشارك في إزالة الحماية من الببتيدات.
